目前，中国科学院可靠性保障中心共有2个总体技术部、8个分中心、10+家专业实验室。包括：

总体技术部（北京分部）依托空间应用工程与技术中心；

总体技术部（上海分部）依托微小卫星创新研究院；

第一分中心为通用检测实验室，依托国家空间科学中心；

第二分中心为复杂元器件检测实验室，依托微电子研究所；

第三分中心为处理器类检测实验室，依托计算技术研究所；

第四分中心为DSP/MCU类检测实验室，依托自动化研究所；

第五分中心为真空电子器件/FPGA/激光器类检测实验室，依托空天信息创新研究院；

第六分中心为光电器件类检测实验室，依托半导体研究所；

第七分中心为累积辐射效应检测实验室，依托新疆理化技术研究所；

第八分中心为瞬态辐射效应检测实验室，依托近代物理研究所；

激光器与图像传感器检测实验室，与长春光学精密机械与物理研究所共建；

红外焦平面探测器检测实验室，与上海技术物理研究所共建；

电子功能材料检测实验室，与宁波材料技术与工程研究所共建；

固体激光器与特种光源检测实验室，与上海光学精密机械研究所共建；

光抽运小铯钟检测实验室，与国家授时中心共建；

光电显示器件检测实验室，与理化技术研究所共建；

光电器件性能标定实验室，与高能物理研究所共建；

IGBT检测实验室，与国科赛思(北京)科技有限公司共建；

VDMOS检测实验室，与北京中科新微特科技开发股份有限公司共建；

光电综合元器件检测实验室，与中航光电科技股份有限公司共建；

光电传输组件检测实验室，与青岛兴航光电技术有限公司共建。